当初朱温全力抵御蔡州巨寇秦宗权，数年鏖战、疲于奔命之际，身处山东的郓州天平节度使朱瑄、兖州泰宁节度使朱瑾，感念昔日结义之情，亦深知唇齿相依之理，屡屡亲率兖郓兵马远赴汴州驰援，数次帮朱温化解围城绝境、击退秦宗权重兵，是朱温早年立足中原、大破强敌的重要外援。
待到秦宗权主力彻底溃败、中原战局尘埃落定，朱温感念二朱数次救援之恩，又因彼此同姓同乡、曾结兄弟之盟，心存感念，遂备下重金厚币、锦绣珍宝，重重犒劳兖郓援军，礼送朱瑄、朱瑾率军返回山东属地。
奈何乱世藩镇，唯利是图、情义淡薄。朱瑄、朱瑾目睹朱温麾下宣武军将士个个悍勇善战、军纪严明、战力冠绝天下，心中暗自艳羡觊觎，图谋扩充自家军力、蚕食朱温根基。二人私下定下计策，暗中在曹州、濮州边境广布告示，悬以重金、厚帛、良田重赏，公然招揽、诱降宣武军士卒。
彼时乱世流民士卒皆以衣食财货为立身根本，宣武军不少底层兵士贪图重利，感念厚赏，纷纷背汴投兖、弃主叛逃，短期内叛亡者人数众多，严重动摇宣武军军心根基、损耗朱温战力。
朱温得知此事勃然大怒，昔日兄弟情义、救命恩情尽数烟消云散。他即刻草拟檄文，遣使传至郓州，严词谴责朱瑄背信弃义、私招叛卒、破坏盟约、构陷邻镇的不义之举。熟料朱瑄自恃有功于朱温，又坐拥山东二镇地盘、军力强盛，态度倨傲无礼，回书言辞傲慢、肆意辩驳、毫无愧悔之心，处处讥讽朱温气量狭小、小题大做。
自此，昔日守望相助的结义兄弟彻底反目成仇，朱温与兖郓二镇的生死矛盾彻底爆发，山东十年藩镇拉锯战正式拉开序幕。
景福元年（892年）二月三日，朱温决意兴兵问罪、征讨郓州，正式开启兼并山东的霸业征程。他整饬三军、亲率大军北征，先行派遣长子朱友裕为先锋，领兵进驻斗门，修筑营垒、囤积粮草，作为大军主攻郓州的前沿据点。
二月九日，朱友裕移军驻扎衢南，分兵布防、伺机进军。朱瑄探得汴州军虚实，趁朱友裕立足未稳、营寨未固，连夜率领一万精锐步骑奔袭而至，突袭汴军大营。朱友裕猝不及防、阵型大乱，仓促应战、节节败退，最终不敌郓州精兵，只得率领残部向南仓皇撤退，斗门营寨尽数失守。
二月十日清晨，朱温亲率后援主力赶赴斗门驰援，全然不知昨夜先锋军已然溃败撤离、营寨已被敌军占据。先行抵达斗门的汴州前锋士卒毫无防备，尽数陷入朱瑄伏兵包围，全军覆没、悉数战死。
朱温随后抵达，见营寨残破、尸横遍野，方知中计，当即督军追击逃窜的郓州兵马，奈何敌军早已远遁，最终无功而返。为重整兵马、规避埋伏，朱温只得引军暂驻乡野村落，休整士卒、探查敌情。此时朱瑄主力仍盘踞同州，伺机再战、虎视眈眈。
二月十二日，朱温整顿残军、再度率军逼近郓州，不料再度遭遇朱瑄回师突袭。敌军攻势迅猛、四面合围，汴军阵脚大乱、全线溃散。朱温身陷乱军之中，身边亲兵寥寥无几，情势万分危急，只得策马疾驰、拼死突围，一路向南奔逃，历经艰险方才摆脱追兵、侥幸脱险，此战朱温初战惨败、折损颇多。
乾宁元年（894年）二月，朱温厉兵秣马、养精蓄锐，再度亲率宣武精锐大举北伐，从郓州东路长驱直入，挥师北进，直逼鱼山地界。
朱瑄侦得朱温大军动向，不敢怠慢，即刻集结郓州全部主力兵马，星夜疾驰，直奔鱼山拦截汴军。两军于鱼山脚下猝然相遇，未及列阵休整，便即刻展开大规模血战。
郓州军虽拼死冲杀、奋力抵抗，但历经连年征战、战力早已不及久经沙场的宣武精锐。几番鏖战之后，朱瑄大军彻底溃败、尸横遍野，此战斩杀郓州士卒一万余人，血水浸染山野、尸积如山。残余败兵惊慌失措、自相踩踏，狼狈逃窜，尽数蜷缩退守清河城，闭门死守、不敢出战。
朱温大胜之后，为彰显战功、震慑山东诸镇，下令收拢战场敌军尸骸，于鱼山之下堆积夯筑高大坟冢，造京观以纪大捷、威慑四方。随后大军驻守鱼山数日，肃清周边残敌、稳固战果，方才班师返回汴州。
乾宁二年（895年）正月二十九日，朱温改变战术，分兵两路、各个击破，先行攻打势力稍弱的兖州。他派遣心腹大将朱友恭统领大军征伐兖州，大军兵临城下之后，深挖壕沟、广筑壁垒，修筑连绵围困工事，将兖州城团团封锁，彻底断绝内外交通、困死城中守军。
兖州被围日久、粮草匮乏，危在旦夕。朱瑄深知唇亡齿寒，即刻从郓州亲率步骑主力，押运大批粮草辎重，星夜驰援兖州，意图突破汴军包围、入城补给、合力拒敌。
朱友恭早已预判敌军动向，提前在援军必经之路设下重兵伏兵。待朱瑄粮军进入伏击圈，汴军伏兵四起、四面冲杀，郓州援军猝不及防、全军溃败。此战汴军大获全胜，于高吴之地尽数缴获郓州粮草辎重，彻底断绝兖州补给，一战生擒郓州蕃族悍将安福顺、安福庆二人，兖郓联军实力再度重创。
同年十一月，困守兖州、绝境求生的朱瑄不甘坐以待毙，再度拼死解围。他派遣麾下猛将贺瑰、柳存及蕃将何怀宝，统领一万余精锐兵马，绕道奔袭曹州，企图避实击虚、扰乱汴军后方，逼迫朱温撤兖州之围、回师救援。
朱温洞悉敌军计谋，当机立断，从兖州围城前线亲率精锐骑兵，昼夜疾驰、千里奔袭，赶至钜野南部设伏截击。两军激战之下，郓州援军再度惨败、全军被俘，汴军一举生擒贺瑰、柳存、何怀宝三员主将，以及残余士卒三千余人，彻底击溃兖郓二镇有生力量，二朱大势已去、再无反扑之力。
乾宁四年（897年）正月，朱温见兖郓二镇兵力耗尽、军心涣散、已成强弩之末，遂集结洹水全线主力，发动终极决战，大举征伐郓州，意图一举平定山东、根除后患。
正月十五日，朱温大军进至济水沿岸，安营扎寨、列阵对峙。大将庞师古奉命统领前军，砍伐沿岸林木、搭建浮桥，日夜赶工、筹备渡河攻坚，只为直取郓州坚城。
十九日夜，月色昏暗、夜色沉沉，庞师古率领中军精锐率先渡过济水，全军呐喊震天、鼓噪攻城，声势直达郓州城头、震动全城。困守数年、心力俱疲的朱瑄听闻汴军大举渡河、兵临城下，深知大势已去、城破在即，彻底丧失守城斗志，趁着夜色掩护、弃城连夜出逃。
朱温麾下大将葛从周即刻率领精锐骑兵连夜追击，一路穷追不舍，最终于中都北部擒获逃亡的朱瑄及其妻儿家眷，尽数押解回汴州。随后朱温下令，将朱瑄斩杀于汴桥之下，昔日结义兄弟、山东枭雄就此授首。
郓州彻底平定。二十三日，朱温率军进驻郓州城，安抚官吏百姓、整顿城防秩序，任命长子朱友裕为郓州兵马留后，镇守天平军故地，稳固山东西线统治。
此时探马来报，兖州朱瑾因城中粮草耗尽，正与部将史俨儿前往丰、沛一带搜刮粮草、筹措军资，城中仅留大将康怀英孤守兖州，防务空虚。朱温抓住千载良机，乘胜命葛从周统领得胜大军，火速奔袭兖州。
康怀英素来听闻汴军悍勇、屡战屡胜，此刻得知郓州陷落、朱瑄身死，早已军心震恐、斗志全无，又见葛从周大军兵临城下、重围四合，自知孤城难守、无力回天，当即大开城门、率部投降，兖州不战而下。
在外筹粮的朱瑾、史俨儿听闻兖州失守、守将投降、基业尽失，进退无路、无家可归，只得率领残余少量亲随残部，仓皇南逃，投奔淮南节度使杨行密，自此亡命江南、再无翻身可能。
至此，郓州、兖州二镇尽数平定，山东全境纳入朱温版图。朱温随即任命葛从周为兖州留后，镇守泰宁军故地，彻底掌控中原、山东核心腹地，成为雄踞关东的第一强藩，势力远超天下所有藩镇。
光化三年（900年）十一月，大唐朝堂爆发惨烈宦官政变。宦官头目刘季述等人掌控禁军、擅行废立，悍然幽禁唐昭宗，废黜帝号，拥立太子李裕为傀儡皇帝，朝堂大乱、皇权旁落、社稷倾覆在即。
次年年初，素来厌恶宦官专权、意图匡扶皇室的宰相崔胤，暗中联结禁军将领、护驾都头孙德昭等忠义将士，发动反政变，诛杀刘季述等作乱宦官，成功迎唐昭宗复位，平复宫廷内乱。
昭宗重登帝位、改元天复，感念朱温坐拥强兵、忠心拱卫朝廷，且常年平定四方叛乱、安定天下，遂再度加封朱温为东平王，极尽恩宠、倚为社稷柱石。
经此政变，崔胤深知宦官势力根深蒂固、祸乱朝纲百年之久，心中决意彻底根除宦官之患。但宦官掌控禁军、势力盘根错节，朝臣无力制衡，于是崔胤一心想要借朱温的关外强兵入朝，一举诛杀全体宦官、肃清宫闱。
与此同时，幸存宦官韩全诲等人惊惧不已、自知性命难保，为求自保、对抗朝臣与朱温，暗中结连凤翔节度使李茂贞、邠宁节度使王行瑜等关西强藩，引关外藩镇为外援，依仗兵权庇护、抗衡朝廷，朝堂藩镇相互勾连、对立对峙，局势愈发凶险。
同年十月，崔胤为逼朱温入朝除宦，擅自伪造皇帝密诏，传檄汴州，诏令朱温带兵即刻奔赴京师、清君侧、除奸佞。朱温得诏之后，抓住入主中枢、掌控朝廷的千载机遇，即刻集结七万精锐大军，从河中出兵，一路势如破竹，接连攻取同州、华州，兵锋直指京畿，大军直抵长安近郊，威慑关中。
韩全诲等宦官集团闻讯惊恐万状、方寸大乱，为躲避朱温兵锋、挟持天子自保，当即裹挟唐昭宗连夜西逃，奔赴凤翔，投靠藩镇李茂贞，妄图借关西兵力割据自保、对抗朱温。
朱温即刻亲率大军尾随追击，兵临凤翔城下，遣使喊话，坚决要求李茂贞归还昭宗、交出乱臣宦官、护送天子还京。韩全诲垂死挣扎，再度伪造唐昭宗圣旨，下诏勒令朱温即刻撤军、返回本镇，妄图以皇命逼迫朱温退兵、消解兵祸。
天复二年（902年），朱温短暂撤军返回河中休整兵马、重整旗鼓，待军备齐备之后，再度统领大军合围凤翔，层层封锁、日夜猛攻，数次大破李茂贞关西联军，屡战屡胜、威震关中。
期间鄜坊节度使李周彝率军东来驰援李茂贞，意图解围凤翔、抗衡朱温，却在途中被汴军重兵拦截、大败被困，走投无路之下，只得率全军归降朱温，关西援军尽数瓦解。
凤翔孤城被围经年、内外断绝、粮草耗尽，城中粮荒滔天、民生惨烈，军民无粮可食、饥寒交迫，冻饿而死者尸积满城、不可胜计，城内生灵涂炭、人人自危，守军战力彻底枯竭、人心彻底崩塌。
天复三年（903年）正月，李茂贞困守孤城、内无粮草、外无援兵，眼见大势已去、再无抗衡之力，彻底绝望。为求自保、保全性命，只能被迫服软求和，斩杀韩全诲等作乱宦官二十余人，将宦官首级送予朱温，遣使请和、乞降罢兵。
朱温见首恶已除、目的达成，遂应允议和，正式迎唐昭宗离开凤翔、返还长安。自此，历经数次宫廷政变、藩镇混战的唐昭宗，彻底沦为朱温手中的傀儡帝王，大唐皇权彻底旁落、名存实亡，天下大权尽归朱温掌控。
唐昭宗深知自身命运、社稷存亡全系朱温一念之间，心中惊惧敬畏、万般无奈，只得对朱温感慨叹言：“宗庙社稷是卿再造，朕与戚属是卿再生。”
自此昭宗对朱温俯首帖耳、唯命是从，大小朝政、人事任免尽数听从朱温决断，再无半分帝王主权。
朱温入朝掌权之后，为彻底根除百年宦官之祸、杜绝日后宫变再生，杜绝宦官干政后患，大肆搜捕宫中残余宦官，将第五可范等在册宦官七百余人尽数诛杀于内侍省，血流宫闱、根除后患。
自中唐以来盘踞百年、专权乱政、废立帝王的宦官势力，经此屠戮彻底覆灭、连根拔除，延续百年的宦官之患就此终结。
朝廷为酬报朱温再造社稷、肃清宫闱、平定叛乱的盖世功勋，接连加封其显赫官爵：授守太尉、兼中书令，保留宣武军等诸镇节度使实权，加封诸道兵马副元帅，进爵梁王。
同时天子特赐最高荣宠，加封“回天再造竭忠守正功臣”显赫荣誉头衔，御制《杨柳词》五首亲赐朱温，恩宠冠绝古今、权倾天下，为日后朱温代唐建梁、登基称帝奠定了绝对的权力根基。